Da wurde bei Plesk eine Erweitung installier. Eigentlich keine große Sache, jedoch ist hier intern irgendwie vieles schief gelaufen und am Ende waren alle Webseiten nicht mehr erreichbar. Die Erweiterung hat einfach nginx beschädigt, so dass am Ende diese neu installiert werden musste und einiges andere am Server noch neu erstellt werden musste.
Nach einigen Stunden suchen, reparieren und Lösungen finden funktioniert der Server nun glücklicherweise wieder wie er soll. Hoffe das bleibt erst einmal so. Die Daten wurden weiterhin aufgezeichnet, so dass es hier keine Lücken gibt. So ein VPS (virtueller Server) ist sehr sensibel und mag kleine Veränderungen gar nicht. Um so schöner wenn alle wieder störungsfrei läuft.